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May 13 2010

SVG绘人类染色体G带图

认识和了解基因组,看其基因组图谱可说是直观、简单、入门级的途径。通过NCBI的MapViewer、EBI的Ensembl,不难发现人类染色体的G带图是最常用的人类基因组图谱表现形式。

什么是染色体G带图?

将染色体经盐、碱、热、胰酶或蛋白酶、尿素及去垢剂等处理,再用Giemsa染液染色,染色体会沿其纵轴显示出深浅不同的横纹,此横纹为染色体的G带;绘成图谱,则为染色体G带图(ideogram)。

什么是SVG?

SVG (Scalable  Vector Graphics),可伸缩矢量图形,是使用XML格式定义用于网络的基于矢量的图形。

在很多领域,人们会用Matlab绘图。这里我用SVG,因为我觉得它看起来相对容易。如,画出人类1号染色体的轮廓

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